Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
IFT140Q96RY7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
IFT140Q96RY7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IFT140Q96RY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms