Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED4Q96RK1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED4Q96RK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms