Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FERD3LQ96RJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms