Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
LMTK3Q96Q04 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMTK3Q96Q04 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMTK3Q96Q04 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms