Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms