Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPG4P5Q96PW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms