Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3Q96PU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms