Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ7

KLHL5, Kelch-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL5Q96PQ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL5Q96PQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL5Q96PQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms