Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SORCS2Q96PQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms