Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZIM3Q96PE6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIM3Q96PE6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIM3Q96PE6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms