Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG8Q96MW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG8Q96MW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms