Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms