Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms