Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC138Q96M89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC138Q96M89 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms