Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALR3Q96L12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALR3Q96L12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms