Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms