Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDLIM2Q96JY6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms