Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSIG2Q96IQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG2Q96IQ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms