Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms