Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPNQ96H22 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms