Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms