Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEIL1Q96FI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEIL1Q96FI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms