Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX11Q96FC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX11Q96FC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms