Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms