Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF653Q96CK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms