Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms