Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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FAM3DQ96BQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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