Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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