Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms