Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP7Q93009 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP7Q93009 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP7Q93009 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP7Q93009 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP7Q93009 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP7Q93009 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP7Q93009 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP7Q93009 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP7Q93009 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP7Q93009 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP7Q93009 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP7Q93009 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP7Q93009 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP7Q93009 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP7Q93009 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP7Q93009 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP7Q93009 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP7Q93009 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP7Q93009 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP7Q93009 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP7Q93009 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP7Q93009 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms