Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDB2Q92466 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DDB2Q92466 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms