Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERVK_113Q902F9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms