Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYDC1Q8WXC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms