Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms