Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF31Q8WWY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms