Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP2Q8WWK9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms