Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELQQ8TDG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms