Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX54Q8TDD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms