Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU6

TDRD7, Tudor domain-containing protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD7Q8NHU6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TDRD7Q8NHU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD7Q8NHU6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TDRD7Q8NHU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD7Q8NHU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD7Q8NHU6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD7Q8NHU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms