Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKVQ8NCB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms