Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms