Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM229BQ8NBD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms