Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC89Q8N998 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms