Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMER3Q8N944 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMER3Q8N944 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms