Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKAIN3Q8N8D7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKAIN3Q8N8D7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms