Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms