Protein–RNA interactions for Protein: Q8N443

RIBC1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC1Q8N443 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIBC1Q8N443 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIBC1Q8N443 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms