Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms