Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms