Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHDC8BQ8IXV7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms